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Novo marcador genético identifica sexo da cavala-japonesa com 100% de precisão

Pesquisadores da Universidade de Kyushu e de instituições parceiras no Japão identificaram a região genômica determinante do sexo na cavala-japonesa (Scomber japonicus) e desenvolveram um marcador molecular de alta precisão. Utilizando resequenciamento genômico de leituras curtas, a equipe confirmou o sistema de determinação sexual do tipo ZZ/ZW e desenvolveu um teste de PCR capaz de identificar o sexo genético dos peixes com taxa de acerto entre 98% e 100%.

A ausência de dimorfismo e o desafio no manejo

A cavala-japonesa é uma espécie de elevado valor comercial e modelo emergente para a aquicultura no Japão. No entanto, o peixe não apresenta diferenças visíveis entre machos e fêmeas até a maturação gonadal. Métodos tradicionais de sexagem, como a canulação, são invasivos, exigem manuseio especializado e causam estresse aos reprodutores. Além disso, a gestão reprodutiva em cativeiro exige o ajuste preciso de tratamentos hormonais e a prevenção de desovas indesejadas nos tanques, que poderiam comprometer a integridade genética de populações selvagens.

Mapeamento genômico e descoberta da deleção no cromossomo W

Para superar a limitação de marcadores baseados em SNPs, que podem variar entre populações regionais, os cientistas focaram na busca por variantes estruturais em dados de sequenciamento de leituras curtas. A análise revelou uma alta concentração de variantes exclusivas das fêmeas no cromossomo 24, registrando 2.910 variantes por megabase. No detalhamento dessa região, a equipe identificou uma deleção característica de 891 pares de bases no cromossomo W, em comparação com o cromossomo Z.

Validação em populações e genes candidatos ao sexo

Com base nessa alteração estrutural, os pesquisadores desenharam um conjunto de primers para reação em cadeia da polimerase. O marcador gera uma única banda em machos (ZZ) e duas bandas em fêmeas (ZW), atuando com controle interno de amplificação. O teste foi validado em 144 indivíduos de duas populações, uma cultivada e outra selvagem da ilha de Tsushima, atingindo até 100% de concordância entre o genótipo e o fenótipo sexual. A triagem também identificou oito genes sobrepostos a variantes estruturais, dos quais rgn e rgap6 apresentaram variações de expressão no tecido gonadal, despontando como candidatos a atuarem no desenvolvimento sexual da espécie.

Aplicações práticas para a piscicultura

O método oferece uma ferramenta acessível, não invasiva e confiável para a triagem em massa de matrizes, facilitando o manejo reprodutivo e o controle de lotes monossexo em fazendas marinhas.

Fonte: Structural variant calling via short-read resequencing advances sex identification marker and uncovers new sex-associated candidate genes for chub-mackerel (Scomber japonicus)

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